Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása

Korcsmáros Tamás
Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása.
Doctoral thesis (PhD), University of Szeged.
(2011) (Unpublished)

[thumbnail of Korcsmáros_értekezés.pdf]
Preview
PDF (thesis)
Download (3MB)
[thumbnail of Korcsmáros_tézis_HUN.pdf]
Preview
PDF (booklet)
Download (510kB)
[thumbnail of Korcsmáros_thesis-ENG.pdf]
Preview
PDF (booklet)
Download (252kB)
Official URL: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/2...

Abstract in foreign language

A különböző diszciplínák integrálása, és az eredmények hálózatos módszerekkel történő vizsgálata a jelátviteli útvonalak kutatásának egy új irányzata. A bemutatott munkában öt terület, a biokémia, a genetika, a sejtbiológia, a bioinformatika és rendszerbiológia eredményeit és módszereit integráltam, hogy három többsejtű élőlény (a Caenorhabditis elegans, a Drosophila melanogaster és az ember) jelátviteli útvonalainak hálózatát felépítsem egy erre a célra készített programkörnyezetben. A gyűjtést manuálisan és egységes szabályok szerint végeztem, bioinformatikai forrásokat és tudományos publikációkat alkalmazva. A létrejött hálózati adatbázis, amelyet SignaLinknek neveztünk el, 8 útvonal fehérjéit és irányított kapcsolatait tartalmazza, és megjelöli a jelátviteli kapcsolatok eredeti hivatkozásait. Az adatbázison elvégzett elemzések során új jelátviteli fehérjéket, szövet- és betegségspecifikus cross-talk fehérjéket, a jelátviteli hálózat felépítése és működése szempontjából fontos kulcsfehérjéket és új gyógyszercélpont-jelölteket azonosítottunk. Az doktori munkám során kapott új tudományos eredményeim a következők: 1. Egységes gyűjtési szabályrendszer alapján létrehoztam a SignaLink adatbázist, hogy megalapozzam a jelátvitel rendszerszintű és összehasonlítható elemzését. 2. Összeállítottam három többsejtű faj, a C. elegans, a D. melanogaster és a H. sapiens 8 jelátviteli útvonalának hálózatát, és 253 új jelátviteli komponenst (szignalógot) azonosítottam. 3. Rendszerszintű elemzéssel a jelátviteli hálózat jelterjedésében és evolúciójában kritikus 192 kulcsfehérjét azonosítottunk. 4. Megvizsgálva a szignalógok és a cross-talkban fontos fehérjék tulajdonságait, sikerült kiemelnem 30 ígéretes, új gyógyszercélpont-jelöltet és az 57 kritikus pont gyógyszerészeti fontosságát.

Item Type: Thesis (Doctoral thesis (PhD))
Creators: Korcsmáros Tamás
Title of the thesis in foreign language: System-level database and analyses of signaling pathways: identification of novel protein functions, signaling cross-talks and drug targets
Supervisor(s):
Supervisor
Position, academic title, institution
MTMT author ID
Vellai Tibor
egyetemi docens, Eötvös Loránd Tudományegyetem, Genetikai Tanszék
UNSPECIFIED
Csermely Péter
egyetemi tanár, Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani Intézet
UNSPECIFIED
Papp Balázs
tudományos főmunkatárs, Magyar Tudományos Akadémia, Szegedi Biológiai Központ, Biokémiai Intézet
UNSPECIFIED
Subjects: 01. Natural sciences > 01.06. Biological sciences
Divisions: Doctoral School of Biology
Discipline: Natural Sciences > Biology
Language: Hungarian
Date: 2011. November 28.
Item ID: 834
MTMT identifier of the thesis: 2774806
doi: https://doi.org/10.14232/phd.834
Date Deposited: 2011. Jun. 02. 14:41
Last Modified: 2019. Jul. 19. 13:43
Depository no.: B 4968
URI: https://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/834
Defence/Citable status: Defended.

Actions (login required)

View Item View Item