Korcsmáros Tamás
Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása.
Doctoral thesis (PhD), University of Szeged.
(2011)
(Unpublished)
![[thumbnail of Korcsmáros_értekezés.pdf]](https://doktori.bibl.u-szeged.hu/style/images/fileicons/application_pdf.png) Preview |
PDF
(thesis)
Download (3MB) |
Preview |
PDF
(booklet)
Download (510kB) |
Preview |
PDF
(booklet)
Download (252kB) |
Abstract in foreign language
A különböző diszciplínák integrálása, és az eredmények hálózatos módszerekkel történő vizsgálata a jelátviteli útvonalak kutatásának egy új irányzata. A bemutatott munkában öt terület, a biokémia, a genetika, a sejtbiológia, a bioinformatika és rendszerbiológia eredményeit és módszereit integráltam, hogy három többsejtű élőlény (a Caenorhabditis elegans, a Drosophila melanogaster és az ember) jelátviteli útvonalainak hálózatát felépítsem egy erre a célra készített programkörnyezetben. A gyűjtést manuálisan és egységes szabályok szerint végeztem, bioinformatikai forrásokat és tudományos publikációkat alkalmazva. A létrejött hálózati adatbázis, amelyet SignaLinknek neveztünk el, 8 útvonal fehérjéit és irányított kapcsolatait tartalmazza, és megjelöli a jelátviteli kapcsolatok eredeti hivatkozásait. Az adatbázison elvégzett elemzések során új jelátviteli fehérjéket, szövet- és betegségspecifikus cross-talk fehérjéket, a jelátviteli hálózat felépítése és működése szempontjából fontos kulcsfehérjéket és új gyógyszercélpont-jelölteket azonosítottunk. Az doktori munkám során kapott új tudományos eredményeim a következők: 1. Egységes gyűjtési szabályrendszer alapján létrehoztam a SignaLink adatbázist, hogy megalapozzam a jelátvitel rendszerszintű és összehasonlítható elemzését. 2. Összeállítottam három többsejtű faj, a C. elegans, a D. melanogaster és a H. sapiens 8 jelátviteli útvonalának hálózatát, és 253 új jelátviteli komponenst (szignalógot) azonosítottam. 3. Rendszerszintű elemzéssel a jelátviteli hálózat jelterjedésében és evolúciójában kritikus 192 kulcsfehérjét azonosítottunk. 4. Megvizsgálva a szignalógok és a cross-talkban fontos fehérjék tulajdonságait, sikerült kiemelnem 30 ígéretes, új gyógyszercélpont-jelöltet és az 57 kritikus pont gyógyszerészeti fontosságát.
| Item Type: | Thesis (Doctoral thesis (PhD)) |
|---|---|
| Creators: | Korcsmáros Tamás |
| Title of the thesis in foreign language: | System-level database and analyses of signaling pathways: identification of novel protein functions, signaling cross-talks and drug targets |
| Supervisor(s): | Supervisor Position, academic title, institution MTMT author ID Vellai Tibor egyetemi docens, Eötvös Loránd Tudományegyetem, Genetikai Tanszék UNSPECIFIED Csermely Péter egyetemi tanár, Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani Intézet UNSPECIFIED Papp Balázs tudományos főmunkatárs, Magyar Tudományos Akadémia, Szegedi Biológiai Központ, Biokémiai Intézet UNSPECIFIED |
| Subjects: | 01. Natural sciences > 01.06. Biological sciences |
| Divisions: | Doctoral School of Biology |
| Discipline: | Natural Sciences > Biology |
| Language: | Hungarian |
| Date: | 2011. November 28. |
| Item ID: | 834 |
| MTMT identifier of the thesis: | 2774806 |
| doi: | https://doi.org/10.14232/phd.834 |
| Date Deposited: | 2011. Jun. 02. 14:41 |
| Last Modified: | 2019. Jul. 19. 13:43 |
| Depository no.: | B 4968 |
| URI: | https://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/834 |
| Defence/Citable status: | Defended. |
Actions (login required)
 |
View Item |
EPrints item download statistics
EPrints item download statistics
