A szálkaperje (Brachypodium distachyon) LOB-domain transzkripciós faktorok géncsaládjának jellemzése, és két fehérjéjének kölcsönhatás-vizsgálata

Gombos Magdolna
A szálkaperje (Brachypodium distachyon) LOB-domain transzkripciós faktorok géncsaládjának jellemzése, és két fehérjéjének kölcsönhatás-vizsgálata.
Doktori (PhD) értekezés, Szegedi Tudományegyetem (2000-).
(2018) (Kéziratban)

[thumbnail of doktori_értekezés-gombos-magdolna.pdf]
Előnézet
Szöveg (Disszertáció)
Download (5MB) | Előnézet
    [thumbnail of tézisfüzet-magyar.pdf]
    Előnézet
    Szöveg (Tézisfüzet)
    Download (502kB) | Előnézet
      [thumbnail of tézisfüzet-angol.pdf]
      Előnézet
      Szöveg (Tézisfüzet)
      Download (439kB) | Előnézet
        [thumbnail of elektronikus_melléklet1.pdf]
        Előnézet
        Szöveg (Melléklet)
        Download (504kB) | Előnézet
          [thumbnail of elektronikus_melléklet2.pdf]
          Előnézet
          Szöveg (Melléklet)
          Download (443kB) | Előnézet
            [thumbnail of elektronikus_melléklet4.pdf]
            Előnézet
            Szöveg (Melléklet)
            Download (320kB) | Előnézet
              [thumbnail of elektronikus_melléklet3.pdf] Szöveg (Melléklet)
              Download (505kB)

                Magyar nyelvű absztrakt

                Kutatásaink középpontjában egy olyan, csak növényekben fellelhető transzkripciós faktor család – a LOB-domain (LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN) transzkripciós faktorok családja (röviden LBD) - áll, amely központi szerepet tölt be a merisztematikus sejtcsoportok működésének és a belőlük lefűződő sejtek differenciálódásának jól összehangolt szabályozásában. Habár igazoltan részt vesznek szinte minden szervfejlődési folyamatban az embriogenezistől egészen a terméshozásig, pontos szerepüket mindezidáig csak néhány esetben sikerült meghatározni. Emellett a rendelkezésre álló információk döntő többsége lúdfűvel (Arabidopsis thaliana), mint elsőszámú kétszikű növényi modellszervezettel végzett kutatásokból származik. Egyszikűekben betöltött funkcióik kevéssé ismertek. Célunk az LBD gének szerepének felderítése a szálkaperjével (Brachypodium distachyon), mint kalászos gabonaféléink széles körben elfogadott modellnövényével végzett kutatásokon keresztül. Jelen munkában bemutatásra kerül a szálkaperjében fellelhető LBD gének részletes szekvencia-elemzéssel történő azonosítása, rokonsági kapcsolataik vizsgálata, valamint kifejeződési mintázatuk gyökércsúcstól egészen a hajtáscsúcsig, vegetatív és generatív szervekre egyaránt kiterjedő, valós idejű PCR (quantitative real-time polimerase chain reaction) technikával történő részletes analízise. Szerepelnek továbbá két, az aprólékos vizsgálatok alapján kiválasztott, egymással közel rokon LBD gén (Bd2g34520- BdLBD1C-1 valamint a Bd2g53690- BdLBD1C-2) sejtciklus szabályozásával való összefüggéseire irányuló kutatásaink.

                Absztrakt (kivonat) idegen nyelven

                Our researches focus on a plant specific transcription factor family termed as LOB-domain or LBD (LATERAL ORGAN BOUNDARIES). LBDs have an essential role in coordination of meristematic stem cell activity and differentiation of daughter cells. Although it was demonstrated several times that LBDs are required for several aspects of plant organogenesis from embryogenesis to seed production, only few members of the family have been characterized functionally yet. Moreover, knowledge on LBDs mainly come from Arabidopsis experiments. We have hardly any information about role of LBDs in monocots. Our long-term aims are revealing the function of LBDs in monocot development by using Brachypodium distachyon as a model organism of grasses and cereals. In this study we present the comprehensive characterisation of LBD gene family in Brachypodium including identification, detailed phylogenetic analysis and defining tissue and plant part specific expression pattern of family members by qRT-PCR. For characterization of expression profile we collected 37 different plant parts from root tip to shoot apex both from vegetative and generative phase. Based on this detailed expression profile analysis and on the basis of previous experiments of our laboratory we selected two family members (BdLBD1C-1 -Bd2g34520 and BdLBD1C-2 -Bd2g53690) for further studies. Here we present preliminary results of our experiments regarding to studies on potential connection of these two Brachypodium LBDs to the cell cycle machinery.

                Mű típusa: Disszertáció (Doktori (PhD) értekezés)
                Publikációban használt név: Gombos Magdolna
                Idegen nyelvű cím:Characterization of LOB-domain transcription factor family of Brachypodium distachyon and testing protein interactions regarding to two members of the family
                Témavezető(k):
                Témavezető neve
                Beosztás, tudományos fokozat, intézmény
                MTMT szerző azonosító
                Györgyey János
                tudományos főmunkatárs, PhD, MTA SZBK Növénybiológiai Intézet
                10002548
                Szakterület:01. Természettudományok > 01.06. Biológiai tudományok
                Doktori iskola:Biológia Doktori Iskola
                Tudományterület / tudományág:Természettudományok > Biológiai tudományok
                Nyelv:magyar
                Védés dátuma:2018. március 06.
                EPrint azonosító (ID):4062
                A mű MTMT azonosítója:3401772
                doi:https://doi.org/10.14232/phd.4062
                A feltöltés ideje:2017. szept. 18. 15:56
                Utolsó módosítás:2020. nov. 23. 15:46
                Raktári szám:B 6335
                URI:https://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/4062
                Védés állapota: védett

                Actions (login required)

                Tétel nézetTétel nézet