Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása

Korcsmáros Tamás
Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása.
Doktori értekezés, Szegedi Tudományegyetem (2000-).
(2011) (Kéziratban)

[thumbnail of Korcsmáros_értekezés.pdf]
Előnézet
PDF (disszertáció)
Download (3MB)
[thumbnail of Korcsmáros_tézis_HUN.pdf]
Előnézet
PDF (tézisfüzet)
Download (510kB)
[thumbnail of Korcsmáros_thesis-ENG.pdf]
Előnézet
PDF (tézisfüzet)
Download (252kB)
Hivatalos webcím (URL): http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/2...

Absztrakt (kivonat) idegen nyelven

A különböző diszciplínák integrálása, és az eredmények hálózatos módszerekkel történő vizsgálata a jelátviteli útvonalak kutatásának egy új irányzata. A bemutatott munkában öt terület, a biokémia, a genetika, a sejtbiológia, a bioinformatika és rendszerbiológia eredményeit és módszereit integráltam, hogy három többsejtű élőlény (a Caenorhabditis elegans, a Drosophila melanogaster és az ember) jelátviteli útvonalainak hálózatát felépítsem egy erre a célra készített programkörnyezetben. A gyűjtést manuálisan és egységes szabályok szerint végeztem, bioinformatikai forrásokat és tudományos publikációkat alkalmazva. A létrejött hálózati adatbázis, amelyet SignaLinknek neveztünk el, 8 útvonal fehérjéit és irányított kapcsolatait tartalmazza, és megjelöli a jelátviteli kapcsolatok eredeti hivatkozásait. Az adatbázison elvégzett elemzések során új jelátviteli fehérjéket, szövet- és betegségspecifikus cross-talk fehérjéket, a jelátviteli hálózat felépítése és működése szempontjából fontos kulcsfehérjéket és új gyógyszercélpont-jelölteket azonosítottunk. Az doktori munkám során kapott új tudományos eredményeim a következők: 1. Egységes gyűjtési szabályrendszer alapján létrehoztam a SignaLink adatbázist, hogy megalapozzam a jelátvitel rendszerszintű és összehasonlítható elemzését. 2. Összeállítottam három többsejtű faj, a C. elegans, a D. melanogaster és a H. sapiens 8 jelátviteli útvonalának hálózatát, és 253 új jelátviteli komponenst (szignalógot) azonosítottam. 3. Rendszerszintű elemzéssel a jelátviteli hálózat jelterjedésében és evolúciójában kritikus 192 kulcsfehérjét azonosítottunk. 4. Megvizsgálva a szignalógok és a cross-talkban fontos fehérjék tulajdonságait, sikerült kiemelnem 30 ígéretes, új gyógyszercélpont-jelöltet és az 57 kritikus pont gyógyszerészeti fontosságát.

Mű típusa: Disszertáció (Doktori értekezés)
Publikációban használt név: Korcsmáros Tamás
Idegen nyelvű cím: System-level database and analyses of signaling pathways: identification of novel protein functions, signaling cross-talks and drug targets
Témavezető(k):
Témavezető neve
Beosztás, tudományos fokozat, intézmény
MTMT szerző azonosító
Vellai Tibor
egyetemi docens, Eötvös Loránd Tudományegyetem, Genetikai Tanszék
NEM RÉSZLETEZETT
Csermely Péter
egyetemi tanár, Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani Intézet
NEM RÉSZLETEZETT
Papp Balázs
tudományos főmunkatárs, Magyar Tudományos Akadémia, Szegedi Biológiai Központ, Biokémiai Intézet
NEM RÉSZLETEZETT
Szakterület: 01. Természettudományok > 01.06. Biológiai tudományok
Doktori iskola: Biológia Doktori Iskola
Tudományterület / tudományág: Természettudományok > Biológiai tudományok
Nyelv: magyar
Védés dátuma: 2011. november 28.
EPrint azonosító (ID): 834
A mű MTMT azonosítója: 2774806
doi: https://doi.org/10.14232/phd.834
A feltöltés ideje: 2011. jún. 02. 14:41
Utolsó módosítás: 2019. júl. 19. 13:43
Raktári szám: B 4968
URI: https://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/834
Védés állapota: védett

Actions (login required)

Tétel nézet Tétel nézet

Letöltések

Letöltések havi bontásban az elmúlt egy évben