High-throughput transcriptomic analysis of Pseudorabies virus

Oláh Péter
High-throughput transcriptomic analysis of Pseudorabies virus.
Doktori értekezés, Szegedi Tudományegyetem (2000-).
(2017) (Kéziratban)

[thumbnail of Hig-throughput transcriptomic analysis of Pseudorabies virus.pdf]
Előnézet
PDF (disszertáció)
Download (4MB) | Előnézet
[thumbnail of Hig-throughput transcriptomic analysis of Pseudorabies virus Brief summary.pdf]
Előnézet
PDF (tézisfüzet)
Download (99kB) | Előnézet
[thumbnail of A PSEUDORABIES VÍRUS TRANSZKRIPTOMIKAI ELEMZÉSE NAGY ÁTERESZTŐKÉPESSÉGŰ MÓDSZEREKKEL.pdf]
Előnézet
PDF (tézisfüzet)
Download (99kB) | Előnézet

Absztrakt (kivonat) idegen nyelven

The whole-genome sequence of PRV strain Ka was determined by cutting-edge long-read sequencing in order to facilitate accurate transcriptome mapping and further epigenetic studies of the virus. Illumina short-read, high-throughput sequencing was used for the first time on lytic-infection PRV samples in order to create a single-base resolution transcriptome map, along with the detailed polyadenylation landscape of the virus by PA-Seq. In accordance with expectations, most of the viral genome was transcribed, with the exception of several small intergenic repetitive sequences, and loci in the large internal and terminal repeats. Among the findings are a novel polyadenylated lncRNA near the OriL origin of replication, and the single-base resolution mapping of 3′ UTRs across the viral genome. A number of genes exhibited alternative polyadenylation sites, while previously described splice sites were confirmed and expanded with a novel alternative splicing event in the key regulator ep0 gene.

Mű típusa: Disszertáció (Doktori értekezés)
Publikációban használt név: Oláh Péter
Magyar cím: A Pseudorabies vírus transzkriptomikai elemzése nagy áteresztőképességű módszerekkel
Témavezető(k):
Témavezető neve
Beosztás, tudományos fokozat, intézmény
MTMT szerző azonosító
Boldogkői Zsolt
tanszékvezető egyetemi tanár, habil., PhD, DSc, SZTE ÁOK Orvosi Biológiai Intézet
10012608
Szakterület: 03. Orvos- és egészségtudomány > 03.01. Általános orvostudomány
Doktori iskola: Interdiszciplináris Orvostudományok Doktori Iskola
Tudományterület / tudományág: Orvostudományok > Elméleti orvostudományok
Nyelv: angol
Védés dátuma: 2017. április 24.
EPrint azonosító (ID): 3538
A mű MTMT azonosítója: 3266861
doi: https://doi.org/10.14232/phd.3538
A feltöltés ideje: 2017. jan. 17. 16:14
Utolsó módosítás: 2020. máj. 20. 08:46
URI: https://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/3538
Védés állapota: védett

Actions (login required)

Tétel nézet Tétel nézet