Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása

Korcsmaros Tamas
Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása.
Doktori értekezés, Szegedi Tudományegyetem.
(2011)

[img]
Előnézet
PDF (disszertáció)
Download (3MB)
[img]
Előnézet
PDF (tézis)
Download (510kB)
[img]
Előnézet
PDF (tézis)
Download (252kB)
Hivatalos webcím (URL): http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/2...

Absztrakt (kivonat) idegen nyelven

A különböző diszciplínák integrálása, és az eredmények hálózatos módszerekkel történő vizsgálata a jelátviteli útvonalak kutatásának egy új irányzata. A bemutatott munkában öt terület, a biokémia, a genetika, a sejtbiológia, a bioinformatika és rendszerbiológia eredményeit és módszereit integráltam, hogy három többsejtű élőlény (a Caenorhabditis elegans, a Drosophila melanogaster és az ember) jelátviteli útvonalainak hálózatát felépítsem egy erre a célra készített programkörnyezetben. A gyűjtést manuálisan és egységes szabályok szerint végeztem, bioinformatikai forrásokat és tudományos publikációkat alkalmazva. A létrejött hálózati adatbázis, amelyet SignaLinknek neveztünk el, 8 útvonal fehérjéit és irányított kapcsolatait tartalmazza, és megjelöli a jelátviteli kapcsolatok eredeti hivatkozásait. Az adatbázison elvégzett elemzések során új jelátviteli fehérjéket, szövet- és betegségspecifikus cross-talk fehérjéket, a jelátviteli hálózat felépítése és működése szempontjából fontos kulcsfehérjéket és új gyógyszercélpont-jelölteket azonosítottunk. Az doktori munkám során kapott új tudományos eredményeim a következők: 1. Egységes gyűjtési szabályrendszer alapján létrehoztam a SignaLink adatbázist, hogy megalapozzam a jelátvitel rendszerszintű és összehasonlítható elemzését. 2. Összeállítottam három többsejtű faj, a C. elegans, a D. melanogaster és a H. sapiens 8 jelátviteli útvonalának hálózatát, és 253 új jelátviteli komponenst (szignalógot) azonosítottam. 3. Rendszerszintű elemzéssel a jelátviteli hálózat jelterjedésében és evolúciójában kritikus 192 kulcsfehérjét azonosítottunk. 4. Megvizsgálva a szignalógok és a cross-talkban fontos fehérjék tulajdonságait, sikerült kiemelnem 30 ígéretes, új gyógyszercélpont-jelöltet és az 57 kritikus pont gyógyszerészeti fontosságát.

Mű típusa: Disszertáció (Doktori értekezés)
Doktori iskola: Biológia Doktori Iskola
Tudományterület / tudományág: természettudományok > biológiai tudományok
Magyar cím: Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése: új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása
Idegen nyelvű cím: System-level database and analyses of signaling pathways: identification of novel protein functions, signaling cross-talks and drug targets
Témavezető(k):
Témavezető neveBeosztás, tudományos fokozat, intézményEmail
Dr. Vellai Tiboregyetemi docens Eötvös Loránd Tudomány Egyetem, Genetikai Tanszékvellai@falco.elte.hu
Dr. Csermely Péteregyetemi tanár, Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani Intézetcsermely@eok.sote.hu
Dr. Papp Balázstudományos főmunkatárs Magyar Tudományos Akadémia, Szegedi Biológiai Központ, Biokémiai Intézetpappb@brc.hu
EPrint azonosító (ID): 834
Publikációban használt név : Korcsmaros Tamas
A mû MTMT azonosítója: 2774806
doi: 10.14232/phd.834
A feltöltés ideje: 2011. jún. 02. 14:41
Utolsó módosítás: 2015. máj. 04. 10:36
Egyebek (raktári szám): B 4968
URI: http://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/834
Védés állapota: védett

Actions (login required)

Tétel nézet Tétel nézet