A szálkaperje (Brachypodium distachyon) LOB-domain transzkripciós faktorok géncsaládjának jellemzése, és két fehérjéjének kölcsönhatás-vizsgálata

Gombos Magdolna
A szálkaperje (Brachypodium distachyon) LOB-domain transzkripciós faktorok géncsaládjának jellemzése, és két fehérjéjének kölcsönhatás-vizsgálata.
[Thesis] (Unpublished)

[img]
Preview
PDF (disszertáció)
Download (5MB) | Preview
[img]
Preview
PDF (tézis)
Download (502kB) | Preview
[img]
Preview
PDF (tézis)
Download (439kB) | Preview
[img]
Preview
PDF (melléklet)
Download (504kB) | Preview
[img]
Preview
PDF (melléklet)
Download (443kB) | Preview
[img]
Preview
PDF (melléklet)
Download (320kB) | Preview
[img] PDF (melléklet)
Download (92kB)

Abstract in Hungarian

Kutatásaink középpontjában egy olyan, csak növényekben fellelhető transzkripciós faktor család – a LOB-domain (LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN) transzkripciós faktorok családja (röviden LBD) - áll, amely központi szerepet tölt be a merisztematikus sejtcsoportok működésének és a belőlük lefűződő sejtek differenciálódásának jól összehangolt szabályozásában. Habár igazoltan részt vesznek szinte minden szervfejlődési folyamatban az embriogenezistől egészen a terméshozásig, pontos szerepüket mindezidáig csak néhány esetben sikerült meghatározni. Emellett a rendelkezésre álló információk döntő többsége lúdfűvel (Arabidopsis thaliana), mint elsőszámú kétszikű növényi modellszervezettel végzett kutatásokból származik. Egyszikűekben betöltött funkcióik kevéssé ismertek. Célunk az LBD gének szerepének felderítése a szálkaperjével (Brachypodium distachyon), mint kalászos gabonaféléink széles körben elfogadott modellnövényével végzett kutatásokon keresztül. Jelen munkában bemutatásra kerül a szálkaperjében fellelhető LBD gének részletes szekvencia-elemzéssel történő azonosítása, rokonsági kapcsolataik vizsgálata, valamint kifejeződési mintázatuk gyökércsúcstól egészen a hajtáscsúcsig, vegetatív és generatív szervekre egyaránt kiterjedő, valós idejű PCR (quantitative real-time polimerase chain reaction) technikával történő részletes analízise. Szerepelnek továbbá két, az aprólékos vizsgálatok alapján kiválasztott, egymással közel rokon LBD gén (Bd2g34520- BdLBD1C-1 valamint a Bd2g53690- BdLBD1C-2) sejtciklus szabályozásával való összefüggéseire irányuló kutatásaink.

Abstract in foreign language

Our researches focus on a plant specific transcription factor family termed as LOB-domain or LBD (LATERAL ORGAN BOUNDARIES). LBDs have an essential role in coordination of meristematic stem cell activity and differentiation of daughter cells. Although it was demonstrated several times that LBDs are required for several aspects of plant organogenesis from embryogenesis to seed production, only few members of the family have been characterized functionally yet. Moreover, knowledge on LBDs mainly come from Arabidopsis experiments. We have hardly any information about role of LBDs in monocots. Our long-term aims are revealing the function of LBDs in monocot development by using Brachypodium distachyon as a model organism of grasses and cereals. In this study we present the comprehensive characterisation of LBD gene family in Brachypodium including identification, detailed phylogenetic analysis and defining tissue and plant part specific expression pattern of family members by qRT-PCR. For characterization of expression profile we collected 37 different plant parts from root tip to shoot apex both from vegetative and generative phase. Based on this detailed expression profile analysis and on the basis of previous experiments of our laboratory we selected two family members (BdLBD1C-1 -Bd2g34520 and BdLBD1C-2 -Bd2g53690) for further studies. Here we present preliminary results of our experiments regarding to studies on potential connection of these two Brachypodium LBDs to the cell cycle machinery.

Item Type: Thesis (PhD)
Creators: Gombos Magdolna
Title of the thesis in foreign language: Characterization of LOB-domain transcription factor family of Brachypodium distachyon and testing protein interactions regarding to two members of the family
Divisions: Doctoral School of Biology
Discipline label: Natural Sciences > Biology
Defence date label: 2018. March 06.
Item ID: 4062
MTMT id: 3401772
doi: https://doi.org/10.14232/phd.4062
Date Deposited: 2017. Sep. 18. 15:56
Last Modified: 2020. May. 28. 08:46
Depository no.: B 6335
URI: http://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/4062
Defence/Citable status: Defended.

Actions (login required)

View Item View Item

Downloads

Downloads per month over past year