Gümő-specifikus NCR peptidek azonosítása, vad és mutáns Medicago truncatula gyökérgümők összehasonlító fehérjeanalízise, és az NCR247 lehetséges bakteriális interakciós partnereinek felderítése

Dürgő Hajnalka
Gümő-specifikus NCR peptidek azonosítása, vad és mutáns Medicago truncatula gyökérgümők összehasonlító fehérjeanalízise, és az NCR247 lehetséges bakteriális interakciós partnereinek felderítése.
[Thesis] (Unpublished)

[img]
Preview
PDF (disszertáció)
Download (3MB) | Preview
[img]
Preview
PDF (tézis)
Download (653kB) | Preview
[img]
Preview
PDF (tézis)
Download (762kB) | Preview

Abstract in Hungarian

A Medicago truncatula és Sinorhizobium meliloti vagy S. medicae talajlakó baktériumok közötti szimbiózis eredményeként a növényen létrejön egy új szerv, a gyökérgümő. A gyökérgümő belsejében a bejutott baktériumok irreverzibilis differenciálódási folyamat során poliploid, osztódásra képtelen bakteroidokká válnak. A bakteriális átalakulást a növény szabályozza gümő-specifikus fehérjéi révén, melyekből transzkriptom-adatok alapján M. truncatula genomban közel 600 megtalálható. Ezen gének közül 500 körüli azoknak a géneknek a száma, melyek a cisztein-gazdag gümő-specifikus NCR peptideket kódolják. Az NCR peptidek a bakteroidokba jutnak, ahol azok membránjában vagy citoszóljában halmozódnak fel, szerepük a baktériumok átalakulásának kiváltásában, szabályozásában és a nitrogénkötés folyamatában van. Kísérleteinket S. medicae (WSM419) és S. meliloti (Sm1021) baktériumokkal fertőzött Medicago truncatula A17 Jemalong növény indeterminált gümőivel végeztük. Feladatunk legelőször az NCR peptidek MS/MS-alapú azonosítása volt, mely során 138 polipeptid fehérjeszintű jelenlétét igazoltuk bakteroidokban. Az azonosított NCR fehérjéket peptidszinten, MS és retenciós idő alapján is összehasonlítottuk, úgy, hogy különböző tisztítási eljárásokkal fejlettségi állapot szerint különböző bakteroid mintákat készítettünk és analizáltunk. Vad fenotípusú növény gyökérgümőinek vizsgálata mellett M. truncatula 6V mutáns gümőinek növényi és bakteriális eredetű fehérjéit is analizáltuk, szemikvantitatív módon keresve különbségeket a két különböző fenotípusú növény gümőjének fehérjekészletében. Erősen antimikrobiális tulajdonságai miatt különleges NCR247 lehetséges kölcsönható fehérjepartnereinek tömegspektrometriás azonosítását is elvégeztük szabadon élő baktérium és bakteroid mintákból, ezek az eredmények hozzájárulnak az NCR peptidek hatásmechanizmusának jobb megértéséhez.

Item Type: Thesis (PhD)
Creators: Dürgő Hajnalka
Title of the thesis in foreign language: Identification of nodule-specific NCR peptides, comparative proteome analysis of wild type and mutant Medicago truncatula nodules and identification of potential interacting protein targets of NCR247 in endosymbiotic bacteria
Divisions: Doctoral School of Biology
Discipline label: Natural Sciences > Biology
Defence date label: 2015. April 16.
Item ID: 2547
MTMT id: 2994140
doi: https://doi.org/10.14232/phd.2547
Date Deposited: 2015. Feb. 26. 09:59
Last Modified: 2020. Apr. 20. 13:29
Depository no.: B 5858
URI: http://doktori.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/2547
Defence/Citable status: Defended.

Actions (login required)

View Item View Item

Downloads

Downloads per month over past year